RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477373.1

ZYX-209, Transcript of zyxin, human

TSL 4

Gene ZYX, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZYX-209	ENST00000477373	UQCRH	P07919	91 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	KRT7	P08729	469 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MIP	P30301	263 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	OR1D2	P34982	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PTPN7	P35236	360 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GPR15	P49685	360 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	NPY6R	Q99463	290 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	FSCN2	O14926	492 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	TLL1	O43897	1013 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	FGG	P02679	453 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	UROD	P06132	367 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	CTSA	P10619	480 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	BMPR1A	P36894	532 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ARSE	P51690	589 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ARPP19	P56211	112 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	HDAC4	P56524	1084 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	COPS2	P61201	443 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	KRT17	Q04695	432 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RAB33A	Q14088	237 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	TAZ	Q16635	292 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	DDR2	Q16832	855 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	DPF3	Q92784	378 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	TBCB	Q99426	244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	CCDC188	H7C350	402 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	C2CD2L	O14523	706 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	MDM4	O15151	490 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	KRT1	P04264	644 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RARA	P10276	462 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ATF2	P15336	505 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	DES	P17661	470 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ATF6	P18850	670 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	SULT1E1	P49888	294 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	USP46	P62068	366 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	ATP11A	P98196	1134 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	CREM	Q03060	361 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	DUSP4	Q13115	394 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZYX-209	ENST00000477373	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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