RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 ROR1Q01973 937 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ABHD15Q6UXT9 468 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 HSPH1Q92598 858 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 MTBPQ96DY7 904 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 EBF4Q9BQW3 602 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC28BQ9BUN5 200 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PORCNQ9H237 461 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 EBF3Q9H4W6 596 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 MKS1Q9NXB0 559 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 MEI4A8MW99 385 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CHADO15335 359 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 UGT1A9O60656 530 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 KRT37O76014 449 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 SERPINA6P08185 405 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 NAMPTP43490 491 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ACTR2P61160 394 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CUL3Q13618 768 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 TBCCQ15814 346 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 DEPTORQ8TB45 409 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PPP2R3CQ969Q6 453 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 UGT1A7Q9HAW7 530 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 UGT1A10Q9HAW8 530 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 UGT1A8Q9HAW9 530 aa10.76□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 FAM189A1O60320 539 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PRKCHP24723 683 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 MIPP30301 263 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 MMRN1Q13201 1228 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 BMPR2Q13873 1038 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 NOMO1Q15155 1222 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 LIN52Q52LA3 116 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 WDR49Q8IV35 697 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGAP18Q8N392 663 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 FAF2Q96CS3 445 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CALN1Q9BXU9 219 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 MAFGO15525 162 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 FKBP6O75344 327 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PDE1BQ01064 536 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 LAMB3Q13751 1172 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 XKR3Q5GH77 459 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 XYLT1Q86Y38 959 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PDSS2Q86YH6 399 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 LPAR1Q92633 364 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 WNK4Q96J92 1243 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PEBP4Q96S96 227 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CPXM1Q96SM3 734 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 EPAS1Q99814 870 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 RIPK3Q9Y572 518 aa10.75□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 HMX2A2RU54 273 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 BPGMP07738 259 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 AOC1P19801 751 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ARL2P36404 184 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ASPAP45381 313 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 TUBB3Q13509 450 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 RASIP1Q5U651 963 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ACAD11Q709F0 780 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 USP29Q9HBJ7 922 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 S100A14Q9HCY8 104 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 SOX13Q9UN79 622 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 LCTP09848 1927 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 RLFQ13129 1914 aa10.74□□□□□ -0.69
LINC00886-201ENST00000472943 ERBB2P04626 1255 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms