RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GMIP	Q9P107	970 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TLR5	O60602	858 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PGF	P49763	221 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CSRP2	Q16527	193 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	UBR7	Q8N806	425 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	EPN2	O95208	641 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	APBB3	O95704	486 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HOXC13	P31276	330 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GRIA2	P42262	883 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RAD23B	P54727	409 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ORC1	Q13415	861 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DMC1	Q14565	340 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307		Q6ZNB5	142 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PNKP	Q96T60	521 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TSG101	Q99816	390 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.02	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	AXIN1	O15169	862 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ADH5	P11766	374 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	LIMK1	P53667	647 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	GAD2	Q05329	585 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	MESP2	Q0VG99	397 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SCML4	Q8N228	414 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PGAP2-215	ENST00000469307	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33

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