RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-205ENST00000466097 NAGPAQ9UK23 515 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-205ENST00000466097 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-205ENST00000466097 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-205ENST00000466097 USP3Q9Y6I4 520 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-205ENST00000466097 SHISA7A6NL88 538 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-205ENST00000466097 NFATC1O95644 943 aa15.53■□□□□ 0.08
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SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.53■□□□□ 0.08
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SH3BP1-205ENST00000466097 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
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SH3BP1-205ENST00000466097 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
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SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.52■□□□□ 0.08
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SH3BP1-205ENST00000466097 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF276Q8N554 614 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.51■□□□□ 0.07
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 CHRDQ9H2X0 955 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 OSER1Q9NX31 292 aa15.5■□□□□ 0.07
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SH3BP1-205ENST00000466097 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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