RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CALCAP01258 141 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CD4P01730 458 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MT-ND3P03897 115 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ITGB3P05106 788 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 INSRRP14616 1297 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PDGFRAP16234 1089 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GCAP28676 217 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RGS2P41220 211 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PNPLA4P41247 253 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PTPN9P43378 593 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PSMC4P43686 418 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SERPINB9P50453 376 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NAB1Q13506 487 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MPP2Q14168 576 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KRT81Q14533 505 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LRRC14Q15048 493 aa8.87□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 Q3C1V9 767 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF394Q53GI3 561 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 JADE1Q6IE81 842 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ASRGL1Q7L266 308 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TMEM110Q86TL2 294 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BEST2Q8NFU1 509 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MGARPQ8TDB4 240 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CPXM1Q96SM3 734 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 APBA2Q99767 749 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NAT9Q9BTE0 207 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZWILCHQ9H900 591 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MKS1Q9NXB0 559 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 POLIQ9UNA4 740 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 M0QYV0 167 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 APOL1O14791 398 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PEX10O60683 326 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GCATO75600 419 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KRT38O76015 456 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ARIH2O95376 493 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LGALS2P05162 132 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 INHBAP08476 426 aa8.86□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MLNP12872 115 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KRT4P19013 534 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TPSB2P20231 275 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MARK3P27448 753 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ADORA2AP29274 412 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SDC4P31431 198 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CDH6P55285 790 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BCAR1P56945 870 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NCALDP61601 193 aa8.86□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 MAP2K5Q13163 448 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LLGL1Q15334 1064 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TPSAB1Q15661 275 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 AMHR2Q16671 573 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SEZ6Q53EL9 994 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ATG16L1Q676U5 607 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.86□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DPH6Q7L8W6 267 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DPP9Q86TI2 863 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.86□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 BANPQ8N9N5 519 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.86□□□□□ -0.99
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