RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 SETSIPP0DME0 302 aa21.84■■□□□ 1.09
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VARS-218ENST00000459667 STILQ15468 1287 aa21.84■■□□□ 1.09
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VARS-218ENST00000459667 CPA6Q8N4T0 437 aa21.84■■□□□ 1.09
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VARS-218ENST00000459667 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
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VARS-218ENST00000459667 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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