RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 PMM2O15305 246 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 P4HA2O15460 535 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 EGFP01133 1207 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 HOXA6P31267 233 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 FMO5P49326 533 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 RAD23BP54727 409 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 LONP2Q86WA8 852 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 TATDN2Q93075 761 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 ACDQ96AP0 544 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 NT5C1BQ96P26 610 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 ARID3AQ99856 593 aa22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LTB-211ENST00000446745 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 RNF40O75150 1001 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 DHCR24Q15392 516 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CYLDQ9NQC7 956 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 HESX1Q9UBX0 185 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.2■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 HHLA1C9JL84 531 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 K7ESF4 209 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CYP26A1O43174 497 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CYP17A1P05093 508 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 RALAP11233 206 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 BMP6P22004 513 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 KIF11P52732 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 SGO2Q562F6 1265 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.19■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CCDC192P0DO97 292 aa22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ADH5P11766 374 aa22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 FNTBP49356 437 aa22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 LRMPQ12912 555 aa22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 NAGPAQ9UK23 515 aa22.18■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 FRYLO94915 3013 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 IRF1P10914 325 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 RARGP13631 454 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CD19P15391 556 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 BCAT1P54687 386 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 STX17P56962 302 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 GAD2Q05329 585 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 A0A1W2PQH9 124 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 APODP05090 189 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 VDRP11473 427 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 OPRD1P41143 372 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 CAMK4Q16566 473 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 ZNF276Q8N554 614 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PNKPQ96T60 521 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 USP3Q9Y6I4 520 aa22.16■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PAEPP09466 180 aa22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 PLA2G4AP47712 749 aa22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.15■■□□□ 1.14
LTB-211ENST00000446745 HTR3DQ70Z44 454 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms