RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433888.5

PTPN4-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 954 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-205	ENST00000433888	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	CREB1	P16220	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SCP2	P22307	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	NPY5R	Q15761	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	AGPS	O00116	658 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	CCP110	O43303	1012 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TUSC2	O75896	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	RNF8	O76064	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	FGF2	P09038	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PSG1	P11464	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	HSPA6	P17066	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ME1	P48163	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	MCL1	Q07820	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	USP19	O94966	1318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	EVPL	Q92817	2033 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TBX3	O15119	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	HTR6	P50406	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	INSC	Q1MX18	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888		H7C4K7	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	CLIC1	O00299	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	EXOC5	O00471	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	YPEL5	P62699	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	MTX1	Q13505	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	KCNB1	Q14721	858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	RASAL1	O95294	804 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	HGF	P14210	728 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	SLC7A1	P30825	629 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	GATM	P50440	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	HSF1	Q00613	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN4-205	ENST00000433888	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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