RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 B3GAT3O94766 335 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 IRAK1P51617 712 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF623O75123 536 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K6O95382 1288 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RBP3P10745 1247 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DESP17661 470 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HOXD10P28358 340 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RAB27AP51159 221 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 C9orf72Q96LT7 481 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RNF157Q96PX1 679 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TBCBQ99426 244 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MCF2LO15068 1137 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN9P43378 593 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC31Q6UY01 552 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PCED1BQ96HM7 432 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CYLDQ9NQC7 956 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TTC4O95801 387 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 BRCC3P46736 316 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY1Q08828 1119 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 LONRF1Q17RB8 773 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB106AQ8N104 65 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 P3H4Q92791 437 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK16Q96T55 309 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 F8W810 466 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FAM200BP0CF97 657 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 LHX1P48742 406 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA2D1P54289 1103 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC185Q8N715 623 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PQLC3Q8N755 202 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 INHAP05111 366 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CKBP12277 381 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PDK2Q15119 407 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF6Q58WW2 860 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TEKT4Q8WW24 435 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 COX16Q9P0S2 106 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 AP1G2O75843 785 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CABYRO75952 493 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 YY1P25490 414 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TKTL1P51854 596 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TFDP2Q14188 446 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN26Q16670 478 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FAM35AQ86V20 835 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PLD5Q8N7P1 536 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RASGRF2O14827 1237 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MDM4O15151 490 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 GAD2Q05329 585 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MBTPS1Q14703 1052 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FAM131BQ86XD5 332 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TLCD1Q96CP7 247 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ITGB1P05556 798 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SCNN1AP37088 669 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MATKP42679 507 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SULT1E1P49888 294 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 NOMO1Q15155 1222 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FAM26DQ5JW98 314 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms