RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ACOT9Q9Y305 439 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF839A8K0R7 811 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX6P35712 828 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC16Q13042 620 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP51A1Q16850 503 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM5Q71RC9 77 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RDM1Q8NG50 284 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SENP2Q9HC62 589 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OGTO15294 1046 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CTDNEP1O95476 244 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 POU1F1P28069 291 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB8P50452 374 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MCL1Q07820 350 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TROAPQ12815 778 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTN1Q12860 1018 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NFYCQ13952 458 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NCF4Q15080 339 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RASA2Q15283 850 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GLMNQ92990 594 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PAFAH2Q99487 392 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 WDCPQ9H6R7 721 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX20Q9UMR3 447 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf81A6NN90 581 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 F9P00740 461 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGB3P05106 788 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PON1P27169 355 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GLRBP48167 497 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RERGLQ9H628 205 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DIABLOQ9NR28 239 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN4P29074 926 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GPC1P35052 558 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ERAP2Q6P179 960 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF2Q6P1X5 1199 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PGBD3Q8N328 593 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3GL1Q99961 368 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF181Q9P0P0 153 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CASZ1Q86V15 1759 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K13O43283 966 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NBNO60934 754 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CPA3P15088 417 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf74Q86VG3 221 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OPTNQ96CV9 577 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RMND5AQ9H871 391 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF112Q9ULX5 631 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RRM1P23921 792 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RRM2P31350 389 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PDK2Q15119 407 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NOTUMQ6P988 496 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR48Q8TAF3 677 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KAZALD1Q96I82 304 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RBP1P09455 135 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms