RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424751.2

LINC00839-201, long intergenic non-protein coding RNA 839, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00839, Length 2,252 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00839-201ENST00000424751 SELPP16109 830 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 CTNNA2P26232 953 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 LRPAP1P30533 357 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 COPS2P61201 443 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 NCALDP61601 193 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 UPP1Q16831 310 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 GALNTL6Q49A17 601 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 AGAP11Q8TF27 550 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 CD101Q93033 1021 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 RGS18Q9NS28 235 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00839-201ENST00000424751 VWA8A3KMH1 1905 aa14.96□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 F8VP50 259 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SGO2Q562F6 1265 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PRELID2Q8N945 189 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 E5RJQ4 531 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PYGMP11217 842 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SLCO1A2P46721 670 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PEX5P50542 639 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 BNIP1Q12981 228 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ERICH1Q86X53 443 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 STKLD1Q8NE28 680 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ART4Q93070 314 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 KLHL29Q96CT2 875 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ENPP3O14638 875 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 MTA2O94776 668 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 VDRP11473 427 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 KCNJ2P63252 427 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SATB1Q01826 763 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TCEAL1Q15170 157 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 XYLT1Q86Y38 959 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 APPL2Q8NEU8 664 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 B3GAT3O94766 335 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 P4HA1P13674 534 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PKDCCQ504Y2 493 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SERPINB12Q96P63 405 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ATP11AP98196 1134 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CALCOCO2Q13137 446 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 CYP1B1Q16678 543 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 MIS12Q9H081 205 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 HIPK3Q9H422 1215 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00839-201ENST00000424751 SPOPO43791 374 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms