RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 BDNFP23560 247 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 RFC2P35250 354 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 SLC11A1P49279 550 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.92■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 DEFB106AQ8N104 65 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HSPH1Q92598 858 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.92■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 RAB17Q9H0T7 212 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 MED4Q9NPJ6 270 aa21.92■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.92■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 TADA2AO75478 443 aa21.91■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 TIMP1P01033 207 aa21.91■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 DAOAP59103 153 aa21.91■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 NT5C3BQ969T7 300 aa21.91■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.91■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 DPH5Q9H2P9 285 aa21.91■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 KIAA0355O15063 1070 aa21.9■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 PRPSAP2O60256 369 aa21.9■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 FAM71BQ8TC56 605 aa21.9■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 TBCBQ99426 244 aa21.9■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.9■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.9■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.9■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 NEU2Q9Y3R4 380 aa21.9■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 ECEL1O95672 775 aa21.9■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.9■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 TEKT4Q8WW24 435 aa21.9■■□□□ 1.1
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GPC1-202ENST00000420138 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.89■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 E7ENQ6 273 aa21.89■■□□□ 1.09
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GPC1-202ENST00000420138 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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GPC1-202ENST00000420138 NPY6RQ99463 290 aa21.88■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.88■■□□□ 1.09
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