RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 CYP24A1Q07973 514 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TRIM61Q5EBN2 209 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SYT12Q8IV01 421 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 NUP93Q8N1F7 819 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PGBD3Q8N328 593 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 RLN3Q8WXF3 142 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 FBXO32Q969P5 355 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 NACA2Q9H009 215 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CLDN5O00501 218 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PHACTR2O75167 634 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 C1QTNF9P0C862 333 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ATICP31939 592 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 HOXD12P35452 270 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 MAPK8P45983 427 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 GAD2Q05329 585 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 MESP2Q0VG99 397 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 HECTD3Q5T447 861 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 C12orf40Q86WS4 652 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TMEFF1Q8IYR6 380 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SPATA20Q8TB22 786 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TIGD1Q96MW7 591 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 MED10Q9BTT4 135 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SLC32A1Q9H598 525 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TMEM30AQ9NV96 361 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CACNA1GO43497 2377 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 A0A0A0MRY4 1105 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ANTXRLA6NF34 631 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 AP5Z1O43299 807 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 COCHO43405 550 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CFIP05156 583 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PTGER3P43115 390 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TUBP50607 506 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 MYL6P60660 151 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 EMC10Q5UCC4 262 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SLC9A9Q8IVB4 645 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DEFB124Q8NES8 71 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 KCNV2Q8TDN2 545 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SMARCD1Q96GM5 515 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TNIP3Q96KP6 325 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 EXOC1Q9NV70 894 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DMAC2Q9NW81 257 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DEC1Q9P2X7 70 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NME7Q9Y5B8 376 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CLIC2O15247 247 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ADAM23O75077 832 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ENGP17813 658 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SPINK2P20155 84 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SLC5A3P53794 718 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 BIRC3Q13489 604 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ANO4Q32M45 955 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZNF699Q32M78 642 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 MAP7D1Q3KQU3 841 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 FAM35AQ86V20 835 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms