RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ARMCX1Q9P291 453 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PCSK1P29120 753 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMC2Q13753 1193 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RBBP7Q16576 425 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DACT2Q5SW24 774 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NOTUMQ6P988 496 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 AFG1LQ8WV93 481 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP19Q96LK0 163 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MRIQ9BWK5 157 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NPTXRO95502 500 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BCAT1P54687 386 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NCALDP61601 193 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LAYNQ6UX15 382 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP93Q8N1F7 819 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SGF29Q96ES7 293 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 E9PBE3 544 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL41O60662 606 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PAEPP09466 180 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NCAM1P13591 858 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2F1P24903 491 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ELP3Q9H9T3 547 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TOMM70O94826 608 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MIPP30301 263 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC26A2P50443 739 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DPYSL3Q14195 570 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ALLCQ8N6M5 410 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC126Q96EE4 140 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PPME1Q9Y570 386 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 HADHAP40939 763 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MPP3Q13368 585 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CYGBQ8WWM9 190 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 VAV3Q9UKW4 847 aa16.92■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SPEF2Q9C093 1822 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CLPTM1O96005 669 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CXCL8P10145 99 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GP5P40197 560 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RIPK1Q13546 671 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 WLSQ5T9L3 541 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CNDP1Q96KN2 507 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DDIT4Q9NX09 232 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 STRNO43815 780 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TSHRP16473 764 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM131BQ86XD5 332 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMG1O95456 288 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMC3P17980 439 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KDELR1P24390 212 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC1A6P48664 564 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.91■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PCSK7Q16549 785 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 HACD3Q9P035 362 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA9Q13797 1035 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL7BQ6UX53 244 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TRABD2AQ86V40 505 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GGA3Q9NZ52 723 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGAVP06756 1048 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms