RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 CYP26A1O43174 497 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 STIM1Q13586 685 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 C2orf27AQ580R0 203 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 TTC39CQ8N584 583 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 SEMA4DQ92854 862 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 PARD6AQ9NPB6 346 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 RAB20Q9NX57 234 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 AXIN1O15169 862 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 APBB3O95704 486 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 APODP05090 189 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 KDSRQ06136 332 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 TSTD1Q8NFU3 115 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 WHAMMQ8TF30 809 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 OTUB2Q96DC9 234 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 PNKPQ96T60 521 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-202ENST00000378546 DMXL1Q9Y485 3027 aa26.89■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PSMA7O14818 248 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SDHBP21912 280 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGAP8P85298 464 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 GAB4Q2WGN9 574 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 LY6G5CQ5SRR4 150 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TIGD1Q96MW7 591 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CISHQ9NSE2 258 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SCML2Q9UQR0 700 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 LRP3O75074 770 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SLC6A11P48066 632 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 GAD2Q05329 585 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 LRRC63Q05C16 580 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ANO4Q32M45 955 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ISM2Q6H9L7 571 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 USP33Q8TEY7 942 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ARID3AQ99856 593 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF4Q9NR80 690 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SEMA4GQ9NTN9 838 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 K7EQS6 105 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 KAT7O95251 611 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PGFP49763 221 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 DGKEP52429 567 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 C12orf40Q86WS4 652 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TTC30AQ86WT1 665 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 DUSP16Q9BY84 665 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 NAGPAQ9UK23 515 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 A0A1W2PQH9 124 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 HHLA1C9JL84 531 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TBX18O95935 607 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SLC8A3P57103 927 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CBWD6Q4V339 395 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 KBTBD6Q86V97 674 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM176AQ96HP8 235 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CYLDQ9NQC7 956 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 EML5Q05BV3 1969 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SPAG17Q6Q759 2223 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CEP250Q9BV73 2442 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 RARGP13631 454 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TGM1P22735 817 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 C10orf120Q5SQS8 335 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TADA2BQ86TJ2 420 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 NAT16Q8N8M0 369 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 SPATA20Q8TB22 786 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TATDN2Q93075 761 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 RALAP11233 206 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 TIE1P35590 1138 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 GRIA2P42262 883 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CSRP2Q16527 193 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-202ENST00000378546 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms