RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375866.2

CSNK2B-202, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK2B, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-202ENST00000375866 USP18Q9UMW8 372 aa8.51□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.51□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 BIN1O00499 593 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 TNFRSF10BO14763 440 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 LILRB5O75023 590 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 EGFP01133 1207 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CYBBP04839 570 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 COL4A2P08572 1712 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 VDRP11473 427 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RARGP13631 454 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PLA2G4AP47712 749 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FMO5P49326 533 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FNTBP49356 437 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 COG7P83436 770 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 LMNB2Q03252 620 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FZD5Q13467 585 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 DHCR24Q15392 516 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 STILQ15468 1287 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ELF2Q15723 593 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 SDE2Q6IQ49 451 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RNF139Q8WU17 664 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PNKPQ96T60 521 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 SMOQ99835 787 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 DCLK3Q9C098 648 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RNF38Q9H0F5 515 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 IL37Q9NZH6 218 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 DEC1Q9P2X7 70 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 NME7Q9Y5B8 376 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FAM92AA1XBS5 289 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 SHISA7A6NL88 538 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 AXIN1O15169 862 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PMM2O15305 246 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CYP26A1O43174 497 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 MED7O43513 233 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 LRP3O75074 770 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RHOBTB1O94844 696 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CYP17A1P05093 508 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 RETP07949 1114 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 TPM2P07951 284 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PAEPP09466 180 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 SETSIPP0DME0 302 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 GRIA2P42262 883 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ID4P47928 161 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 DGKEP52429 567 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 KIF11P52732 1056 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 SEC13P55735 322 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ARHGAP8P85298 464 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 FOXK2Q01167 660 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 LRMPQ12912 555 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 MORC3Q14149 939 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 DMC1Q14565 340 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CBWD6Q4V339 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 EOGTQ5NDL2 527 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 SYT13Q7L8C5 426 aa8.49□□□□□ -1.05
CSNK2B-202ENST00000375866 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms