RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 KCTD6Q8NC69 237 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MZB1Q8WU39 189 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPH1Q92598 858 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NUDCD1Q96RS6 583 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 KAT6AQ92794 2004 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SCN1AP35498 2009 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 BTBD19C9JJ37 291 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 E7ESA3 106 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SMPD1P17405 629 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SSTR1P30872 391 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF276Q8N554 614 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 C12orf29Q8N999 325 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF12Q96FN5 646 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS11Q9H270 941 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PFKMP08237 780 aa24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 FNBP1LQ5T0N5 605 aa24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 MSS51Q4VC12 460 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX9Q8N6V9 391 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 BANPQ8N9N5 519 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TCP10LQ8TDR4 215 aa24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 E5RJQ4 531 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 SMAPO00193 183 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 NEBLO76041 1014 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF8O76064 485 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TSHRP16473 764 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 PSEN1P49768 467 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CMPK2Q5EBM0 449 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 RFX6Q8HWS3 928 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 MMP3P08254 477 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAP1Q15027 740 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 KIZQ2M2Z5 673 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 DCAKDQ8WVC6 231 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 PPEF2O14830 753 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 LMNAP02545 664 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 GRM5P41594 1212 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDL1Q96EA4 605 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 SYT17Q9BSW7 474 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CALN1Q9BXU9 219 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 MANSC1Q9H8J5 431 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ADCY6O43306 1168 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 STRNO43815 780 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 GRAP2O75791 330 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 APOC2P02655 101 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC25CP30307 473 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 PCK1P35558 622 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ABL2P42684 1182 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 MMRN1Q13201 1228 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBB6Q9BUF5 446 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 NPTXRO95502 500 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 GPD1P21695 349 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CCL15Q16663 113 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF410Q86VK4 478 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 PALM2Q8IXS6 379 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP61Q8NHU2 1237 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 CNPY3Q9BT09 278 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-201ENST00000369862 SETD4Q9NVD3 440 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms