RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CLPBQ9H078 707 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CBX4O00257 560 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CYTH3O43739 400 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FAM107AO95990 144 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 MYL4P12829 197 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CHI3L2Q15782 390 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 APOL2Q9BQE5 337 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ADGRB1O14514 1584 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 B2RBV5 119 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CRTAMO95727 393 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 LSP1P33241 339 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CCNG2Q16589 344 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ILDR2Q71H61 639 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 TBCBQ99426 244 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 GAKO14976 1311 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 VGLL3A8MV65 326 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 GLRA3O75311 464 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 PDHA1P08559 390 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 RARGP13631 454 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 SKOR1P84550 965 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 PPIL2Q13356 520 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FLOT2Q14254 428 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 MARC1Q5VT66 337 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 C16orf89Q6UX73 402 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC33Q8N5R6 958 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 SLC35C1Q96A29 364 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC126Q96EE4 140 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 THTPAQ9BU02 230 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 EML1O00423 815 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 WEE1P30291 646 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 HSD17B3P37058 310 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 RHBDL3P58872 404 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 MED21Q13503 144 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 RIOX2Q8IUF8 465 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 EDEM1Q92611 657 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 WNK4Q96J92 1243 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 PNKPQ96T60 521 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM121Q9BTD3 319 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM150BA6NC51 233 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 IRF6O14896 467 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 AKAP10O43572 662 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ARIH2O95376 493 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CYP3A4P08684 503 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 SERPINF2P08697 491 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 SCNN1BP51168 640 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 HPCAP84074 193 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 VCPIP1Q96JH7 1222 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 TINF2Q9BSI4 451 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 NFASCO94856 1347 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJC3Q13217 504 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 CHADLQ6NUI6 762 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 FBXO25Q8TCJ0 367 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 NT5MQ9NPB1 228 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-202ENST00000366197 LGALS2P05162 132 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 KLRC2P26717 231 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 DMC1Q14565 340 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 CNGA3Q16281 694 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 MCOLN2Q8IZK6 566 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-202ENST00000366197 DTX3LQ8TDB6 740 aa10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms