RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 FESP07332 822 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSD3B1P14060 373 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACRV1P26436 265 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCM5P33992 734 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GATMP50440 423 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE6CP51160 858 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCR5P51681 352 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEUP1Q05D60 604 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTAPQ13126 283 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 BFSP2Q13515 415 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TDGQ13569 410 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDSNQ15517 529 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TREML2Q5T2D2 321 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CERCAMQ5T4B2 595 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ESX1Q8N693 406 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA1Q92805 767 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM89AQ96GI7 184 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM227BQ96M60 508 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MLST8Q9BVC4 326 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEF6Q9H4E7 631 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHODLQ9H9P2 273 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP22Q9UPT9 525 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 A1L4Q6 167 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2W5A6NFC9 320 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGAP5A6NIR3 686 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRSS47A8MTI9 375 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 E7ENX8 843 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 E7EVH7 732 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 J3KRW8 73 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPRY2O43597 315 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM155BO75949 473 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 NTSR2O95665 410 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITGAMP11215 1152 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBL1P28749 1068 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCSK6P29122 969 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC5A2P31639 672 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSG6Q00889 435 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAP2Q03519 686 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC12A1Q13621 1099 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCNIQ14094 377 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLGAP5Q15398 846 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBCCQ15814 346 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP1B1Q16678 543 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC22Q5TAA0 569 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ICE2Q659A1 982 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM180BQ6P0A1 224 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP17L6PQ6QN14 398 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 C16orf89Q6UX73 402 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF276Q8N554 614 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINS1Q8NG48 757 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 XAGE5Q8WWM1 108 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPP4Q96JB8 637 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEPSINQ96N21 525 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR25Q96S07 402 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR24Q96S15 920 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 VN1R3Q9BXE9 311 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSL2Q9HCI7 577 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms