RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRG4Q8WWG1 115 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRGPRX4Q96LA9 322 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUX5Q96PT3 197 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR25Q96S07 402 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 EGFL8Q99944 293 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIMREGQ9BSJ6 248 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIK2Q9H0K1 926 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRD9Q9H8M2 597 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 TDP1Q9NUW8 608 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC28Q9NX36 388 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 DONSONQ9NYP3 566 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGAP1Q9UPQ3 857 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JK05 382 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS29PA6NIE9 313 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOLGA8AA7E2F4 631 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 F8W810 466 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 F2RL2O00254 374 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 CES2O00748 559 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNQ3O43525 872 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDIL3O43854 480 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRLF1O75462 422 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJB1P08034 283 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANOS1P23352 680 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR3P46089 330 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC5A3P53794 718 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCAND1P57086 179 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNJ12Q14500 433 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 LPAL2Q16609 132 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 TKFCQ3LXA3 575 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC93Q567U6 631 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 STPG1Q5TH74 334 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PP632Q6XCG6 107 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 MIGA2Q7L4E1 593 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 NIM1KQ8IY84 436 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 AHI1Q8N157 1196 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR26Q8N8Z3 221 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 NINJ1Q92982 152 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTP4Q96DX8 246 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 HS6ST2Q96MM7 605 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGLYRP2Q96PD5 576 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC2A13Q96QE2 648 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKP4Q99569 1192 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTDSS2Q9BVG9 487 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCLK3Q9C098 648 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR35Q9HC97 309 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 VTA1Q9NP79 307 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 RLIMQ9NVW2 624 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTUQ9ULD6 942 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCLK1O15075 740 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGTAO43765 313 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 ULK1O75385 1050 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 VNN1O95497 513 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLAUP00749 431 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS2P07478 247 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNAI3P08754 354 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 RARBP10826 455 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 FCGR1AP12314 374 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT9P35527 623 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 LOXL3P58215 753 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNAI1P63096 354 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC14A1Q13336 389 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL10RAQ13651 578 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 E2F2Q14209 437 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB39AQ14964 217 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM110CQ1W6H9 321 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 XKR6Q5GH73 641 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAYNQ6UX15 382 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 GADL1Q6ZQY3 521 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTSCR1Q86UQ5 136 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC01465Q8N7H1 131 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCAS4Q8TDM0 211 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP7Q93009 1102 aa0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms