RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MDM4O15151 490 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 EOMESO95936 686 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 APOC2P02655 101 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ETS1P14921 441 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SELPP16109 830 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 CHKAP35790 457 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 RABGGTBP53611 331 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FAM189BP81408 668 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 TFDP2Q14188 446 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 CA9Q16790 459 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 CLLU1OSQ5K130 101 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC25Q86WR0 208 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 DEFB106AQ8N104 65 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FAM76AQ8TAV0 307 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MYLPFQ96A32 169 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FAM149B1Q96BN6 582 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM121Q9BTD3 319 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 AAASQ9NRG9 546 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 DSEQ9UL01 958 aa13□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SGK1O00141 431 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ITGB1P05556 798 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 RARGP13631 454 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 YY1P25490 414 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MATKP42679 507 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFV1P49821 464 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SULT1E1P49888 294 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 CDK7P50613 346 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 TKTL1P51854 596 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 CACNA2D1P54289 1103 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 P3H1Q32P28 736 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 DENND2CQ68D51 928 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MAP7D3Q8IWC1 876 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ZMIZ2Q8NF64 920 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 URGCPQ8TCY9 931 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 RNF157Q96PX1 679 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA4AQ9H3S1 761 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 PCDH9Q9HC56 1237 aa12.99□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 F8W810 466 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 DNM1LO00429 736 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 B4GALT3O60512 393 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FBXO21O94952 628 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT17P0C025 328 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 NOMO2Q5JPE7 1267 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 STRADAQ7RTN6 431 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FAM126BQ8IXS8 530 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SH2D3CQ8N5H7 860 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SUSD3Q96L08 255 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ACBD6Q9BR61 282 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ULBP1Q9BZM6 244 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 C10orf88Q9H8K7 445 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM30AQ9NV96 361 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MCF2LO15068 1137 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 MYZAPP0CAP1 466 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 TYMPP19971 482 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 IL4RP24394 825 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 GPS1Q13098 491 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 BFSP2Q13515 415 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 NOMO1Q15155 1222 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ERMARDQ5T6L9 678 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 KCTD16Q68DU8 428 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 OVOS1Q6IE37 1185 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FAM171BQ6P995 826 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 NPNTQ6UXI9 565 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 VSIG1Q86XK7 387 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF280BQ86YH2 543 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 SLC2A13Q96QE2 648 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 KCNK16Q96T55 309 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 PKMYT1Q99640 499 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 FTHL17Q9BXU8 183 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 PSD3Q9NYI0 1048 aa12.98□□□□□ -0.33
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms