RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 RNF186Q9NXI6 227 aa11.81□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 USP3Q9Y6I4 520 aa11.81□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SQORQ9Y6N5 450 aa11.81□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 A0A0U1RQF3 1178 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ARL5CA6NH57 179 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 M0QZ92 97 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SMAPO00193 183 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 KIF3CO14782 793 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ACSL3O95573 720 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 THP07101 528 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 RBP3P10745 1247 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TGM2P21980 687 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ADORA2BP29275 332 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MATKP42679 507 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MAGEA6P43360 314 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 DYNLT1P63172 113 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ATP11AP98196 1134 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 STAT4Q14765 748 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 UPP1Q16831 310 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ODF2Q5BJF6 829 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 NPNTQ6UXI9 565 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TDRPQ86YL5 185 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SPATA18Q8TC71 538 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SLC2A13Q96QE2 648 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 NPY6RQ99463 290 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CENPHQ9H3R5 247 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 PADI3Q9ULW8 664 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 C5orf60A6NFR6 353 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 HHLA1C9JL84 531 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SGK1O00141 431 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 FYNP06241 537 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 NPR3P17342 541 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MLH1P40692 756 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CLCNKBP51801 687 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 PTK7Q13308 1070 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 LPIN1Q14693 890 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 LONRF1Q17RB8 773 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 RAB41Q5JT25 222 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 PKMYT1Q99640 499 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TLDC2A0PJX2 215 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 GMNCA6NCL1 334 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 C9IYK1 514 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 E7EVH7 732 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 DAB1O75553 588 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 FAM107AO95990 144 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CYP11A1P05108 521 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 LHX1P48742 406 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SEC24CP53992 1094 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 GAD2Q05329 585 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CDO1Q16878 200 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SLC25A52Q3SY17 297 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 FAM171BQ6P995 826 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CYP4X1Q8N118 509 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MDM1Q8TC05 714 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 LPPQ93052 612 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 C9orf72Q96LT7 481 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TTC25Q96NG3 672 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CALN1Q9BXU9 219 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.79□□□□□ -0.52
PGA3-201ENST00000325558 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms