RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 MARK4Q96L34 752 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYH11P35749 1972 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMC3P17980 439 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC5A2P31639 672 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 RHBDL3P58872 404 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCGF5Q86SE9 256 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAD17O75943 681 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT38O76015 456 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC5A3P53794 718 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ORC1Q13415 861 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ART3Q13508 389 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITGA9Q13797 1035 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 DMTF1Q9Y222 760 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCINQ9Y6U3 715 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0B4J269 797 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBX3O15119 743 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPA4LO95757 839 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD48P09326 243 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ESRRGP62508 458 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHEXP78562 749 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 UGT2A3Q6UWM9 527 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 DAW1Q8N136 415 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPAMQ9HCL2 828 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SNED1Q8TER0 1413 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF536O15090 1300 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPST1O60507 370 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIN3BO75182 1162 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPINA6P08185 405 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SREBF1P36956 1147 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPSM2P81274 684 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCSTNQ92542 709 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 MOCOSQ96EN8 888 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNN4O15554 427 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL2O95198 593 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 OCM2P0CE71 109 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRADDP78560 199 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP55Q53EZ4 464 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 C6orf183Q5T699 404 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 LZICQ8WZA0 190 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TGDSO95455 350 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCG1P45844 678 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNK16Q96T55 309 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 STK24Q9Y6E0 443 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAF1P21675 1872 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 HLA-DRAP01903 254 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 GTF2H1P32780 548 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC1A6P48664 564 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 LIG4P49917 911 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 AAGABQ6PD74 315 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 LAYNQ6UX15 382 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF786Q8N393 782 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTLL6Q8N841 843 aa15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLLPQ9Y342 182 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms