RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 APBB2Q92870 758 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM58BPP0C7Q3 252 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SNTNA6NMZ2 147 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 AP1G2O75843 785 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FCGR1AP12314 374 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG4CQ96DT6 458 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KLK14Q9P0G3 267 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NPTX2P47972 431 aa24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ICAM1P05362 532 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RBP1P09455 135 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPOAP1O95153 1857 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 AFF2P51816 1311 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NAMPTP43490 491 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD27Q96NW4 1050 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD10Q9BSF8 475 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FICDQ9BVA6 458 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 EPS8L2Q9H6S3 715 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GARTP22102 1010 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 NMRK1Q9NWW6 199 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMCX4Q5H9R4 360 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMC2Q8TDI7 906 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 DCLK3Q9C098 648 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ACOT9Q9Y305 439 aa24.89■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SAC3D1A6NKF1 404 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 EPB42P16452 691 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC16Q13042 620 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SNAPC2Q13487 334 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC13BO14795 1591 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZK1P1A8MUH7 402 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP3O75969 853 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF682O95780 498 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC1A6P48664 564 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC34A1Q06495 639 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KAT2BQ92831 832 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL4DP49703 201 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP24A1Q07973 514 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CSHL1Q14406 222 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TBCELQ5QJ74 424 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KYQ8NBH2 561 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL10Q9BXB5 764 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT84Q9NSB2 600 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 Q4G0T1 1027 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMPRSS6Q8IU80 811 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.88■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAF2Q12933 501 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 APOL2Q9BQE5 337 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RERGLQ9H628 205 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCC3Q9ULS5 477 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 UPP2O95045 317 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MPOP05164 745 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPER2Q96P56 530 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 UBDO15205 165 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH18Q13634 790 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 AGKQ53H12 422 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CNPY3Q9BT09 278 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms