RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB106AQ8N104 65 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC4Q96A65 974 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 PWWP2AQ96N64 755 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK16Q96T55 309 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 SMOQ99835 787 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.77■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 SGK1O00141 431 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALT3O60512 393 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SHBGP04278 402 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RARGP13631 454 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 IL4RP24394 825 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SLMAPQ14BN4 828 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 FAM76AQ8TAV0 307 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TEKT4Q8WW24 435 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TBCBQ99426 244 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 APOC2P02655 101 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SLC29A2Q14542 456 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NPNTQ6UXI9 565 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CENPHQ9H3R5 247 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 INPPL1O15357 1258 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PCSK1P29120 753 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MATKP42679 507 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TKTL1P51854 596 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PDK2Q15119 407 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 UROC1Q96N76 676 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RNF157Q96PX1 679 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 M0QZQ0 153 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MDM4O15151 490 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN15O75808 1086 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DDHD2O94830 711 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 EOMESO95936 686 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 IFNB1P01574 187 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CYP11A1P05108 521 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MYZAPP0CAP1 466 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 GDF10P55107 478 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CAV1Q03135 178 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DENND2CQ68D51 928 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 METTL23Q86XA0 190 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CDK7P50613 346 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 FAM189BP81408 668 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 GPS1Q13098 491 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 BBOF1Q8ND07 529 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MYLPFQ96A32 169 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RIPK2O43353 540 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT17P0C025 328 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF6Q58WW2 860 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC185Q8N715 623 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA18Q8TC71 538 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM209Q96SK2 561 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ACBD6Q9BR61 282 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NRP1O14786 923 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DAB1O75553 588 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SELPP16109 830 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 LMAN1P49257 510 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SULT1E1P49888 294 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms