RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297598.4

PDP1-201, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDP1, Length 4,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-201ENST00000297598 HMGCRP04035 888 aa15.93■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 FDX1P10109 184 aa15.93■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.93■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.93■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 EDIL3O43854 480 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PEX11AO75192 247 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 RALBP11234 206 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 MLH1P40692 756 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PEX6Q13608 980 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CXorf38Q8TB03 319 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 DCCP43146 1447 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 GDF10P55107 478 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 JAG1P78504 1218 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 WDR27A2RRH5 827 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TBC1D12O60347 775 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CLPTM1O96005 669 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 AMPD1P23109 780 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TAF5Q15542 800 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CCT7Q99832 543 aa15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 KCNK1O00180 336 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ANPEPP15144 967 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SLC1A6P48664 564 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 AAASQ9NRG9 546 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TBX10O75333 385 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 NPTXRO95502 500 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SERPINB9P50453 376 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 AP3M2P53677 418 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 EMC10Q5UCC4 262 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 STKLD1Q8NE28 680 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 MPP4Q96JB8 637 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 AK5Q9Y6K8 562 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 GJB1P08034 283 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 LZTS1Q9Y250 596 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 AKAP10O43572 662 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TPH1P17752 444 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PHKA2P46019 1235 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CNTN2Q02246 1040 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CYP1B1Q16678 543 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 BOLA3Q53S33 107 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ANO7Q6IWH7 933 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TNS4Q8IZW8 715 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CPT1BQ92523 772 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 GPR88Q9GZN0 384 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 KIF1AQ12756 1690 aa15.91■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 E7ENQ6 273 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 APOEP02649 317 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ABHD2P08910 425 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 NME5P56597 212 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 AKT1S1Q96B36 256 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 FAM136AQ96C01 138 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 MCF2P10911 925 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 POLBP06746 335 aa15.9■□□□□ 0.14
PDP1-201ENST00000297598 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms