RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297267.13

FNDC1-201, Transcript of fibronectin type III domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FNDC1, Length 6,552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1-201ENST00000297267 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 KCNJ6P48051 423 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ARL4DP49703 201 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CORO7P57737 925 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 TROAPQ12815 778 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 TEX9Q8N6V9 391 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ATP6V1G2O95670 118 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 JCHAINP01591 159 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 TTI2Q6NXR4 508 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 GPRASP2Q96D09 838 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CISHQ9NSE2 258 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CRYL1Q9Y2S2 319 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ADIGQ0VDE8 80 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 GPR152Q8TDT2 470 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 DNAJC7Q99615 494 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 GSTM1P09488 218 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CAP2P40123 477 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 STARD3Q14849 445 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 FOPNLQ96NB1 174 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 NYAP2Q9P242 653 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.94■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CCND1P24385 295 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 HUNKP57058 714 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 NFYCQ13952 458 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 DOK6Q6PKX4 331 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 OPLAHO14841 1288 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CASP5P51878 434 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 KCNK18Q7Z418 384 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 FLCNQ8NFG4 579 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SELENONQ9NZV5 590 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 RAD51Q06609 339 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ARHGEF6Q15052 776 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CBWD6Q4V339 395 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CBWD3Q5JTY5 395 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CBWD5Q5RIA9 395 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 KAT5Q92993 513 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 FBXO32Q969P5 355 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 NDUFB5O43674 189 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 IL18RAPO95256 599 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 FLT3P36888 993 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SLC1A6P48664 564 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 AP3M2P53677 418 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 RCAN1P53805 252 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 RELTQ969Z4 430 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 MAGEB18Q96M61 343 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 GMFGO60234 142 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 MMRN1Q13201 1228 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 OR8H2Q8N162 312 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 CARD9Q9H257 536 aa15.93■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 HEATR9A2RTY3 570 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 MLNP12872 115 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 S100A5P33763 92 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SCNN1BP51168 640 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 PKNOX1P55347 436 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 MADCAM1Q13477 382 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 NACC2Q96BF6 587 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ADGRB3O60242 1522 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 ZNF197O14709 1029 aa15.92■□□□□ 0.14
FNDC1-201ENST00000297267 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms