RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TINF2Q9BSI4 451 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 VTA1Q9NP79 307 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SENP1Q9P0U3 644 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PLXNB2O15031 1838 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 A0A087WZ62 844 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TOM1L1O75674 476 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PGM1P36871 562 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 GPS1Q13098 491 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MTA1Q13330 715 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 LCA5Q86VQ0 697 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF398Q8TD17 642 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM161BQ96MY7 647 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TTC25Q96NG3 672 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 USTQ9Y2C2 406 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 EVPLQ92817 2033 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 USP1O94782 785 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ARSEP51690 589 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 EFNA5P52803 228 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 GPX6P59796 221 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PPTC7Q8NI37 304 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CPB2Q96IY4 423 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 GALNT8Q9NY28 637 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 AKT3Q9Y243 479 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 UNCXA6NJT0 531 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 RARBP10826 455 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SSTR1P30872 391 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CCL14Q16627 93 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ZPBP2Q6X784 338 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CGRRF1Q99675 332 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 PREBQ9HCU5 417 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TMCO1Q9UM00 188 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 H3BRB1 525 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC1A1P43005 524 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CDK16Q00536 496 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TFDP1Q14186 410 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 WDR44Q5JSH3 913 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CYTH2Q99418 400 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ANPEPP15144 967 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCD1P33897 745 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC26A2P50443 739 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 NCOA4Q13772 614 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 GSTA3Q16772 222 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC142Q17RM4 750 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 KCNN1Q92952 543 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 HAUS1Q96CS2 278 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 FZD8Q9H461 694 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 GINS2Q9Y248 185 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 H3BRJ5 948 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TCF4P15884 667 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-201ENST00000295057 ARL4CP56559 192 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms