RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGAP18Q8N392 663 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF276Q8N554 614 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MSANTD4Q8NCY6 345 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SLC30A5Q8TAD4 765 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ING5Q8WYH8 240 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ASB2Q96Q27 587 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MYADMQ96S97 322 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MIS12Q9H081 205 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TASP1Q9H6P5 420 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 NMUR1Q9HB89 426 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 EPS15L1Q9UBC2 864 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PRKAG3Q9UGI9 489 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PIK3R2O00459 728 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ERBB2P04626 1255 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 GZMAP12544 262 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 BMP1P13497 986 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 WEE1P30291 646 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 GPR158Q5T848 1215 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ERICH1Q86X53 443 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CPA5Q8WXQ8 436 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 C18orf8Q96DM3 657 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PANX2Q96RD6 677 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 NR2E1Q9Y466 385 aa13.9□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQH9 124 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 E7ENQ6 273 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 LAMP2P13473 410 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 FECHP22830 423 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 SCNN1AP37088 669 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 PGFP49763 221 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 PTP4A2Q12974 167 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 TXNDC8Q6A555 127 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ACAD10Q6JQN1 1059 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 BEND5Q7L4P6 421 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ADHFE1Q8IWW8 467 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 SLC46A2Q9BY10 475 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 SYNCQ9H7C4 482 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ASNSD1Q9NWL6 643 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 OSER1Q9NX31 292 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 NAGPAQ9UK23 515 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 NENFQ9UMX5 172 aa13.89□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf78A6NCI8 922 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 GLI1P08151 1106 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ZP2Q05996 745 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 HECTD3Q5T447 861 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 KLHDC10Q6PID8 442 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 MON1BQ7L1V2 547 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 SLC26A9Q7LBE3 791 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 XYLT1Q86Y38 959 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 MAB21L3Q8N8X9 362 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 SPC24Q8NBT2 197 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 MCRS1Q96EZ8 462 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 VCPIP1Q96JH7 1222 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ZSWIM3Q96MP5 696 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ASB16Q96NS5 453 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 CHP1Q99653 195 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf70Q9BRQ4 267 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R14Q9NYV8 317 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC42-201ENST00000293845 STRIP2Q9ULQ0 834 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms