RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SYPL2Q5VXT5 272 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ZBED8Q8IZ13 594 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DEFB106AQ8N104 65 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RAET1EQ8TD07 263 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TBCBQ99426 244 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CEP41Q9BYV8 373 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CARNS1A5YM72 827 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 IL4RP24394 825 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HOXC8P31273 242 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 IFNAR2P48551 515 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LPIN1Q14693 890 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LRRC14Q15048 493 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 EDEM1Q92611 657 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KIAA1257Q9ULG3 409 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NRP1O14786 923 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AVILO75366 819 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NUMBP49757 651 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BCAT1P54687 386 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SLMAPQ14BN4 828 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CYP4X1Q8N118 509 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PCED1BQ96HM7 432 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 E7EVH7 732 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 OR4Q2P0C623 313 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 USP17L7P0C7H9 530 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GBE1Q04446 702 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MSS51Q4VC12 460 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 UNC93AQ86WB7 457 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 P3H4Q92791 437 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SLCO2A1Q92959 643 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 POM121Q96HA1 1249 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 VPS37BQ9H9H4 285 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LRRC4Q9HBW1 653 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CREB3O43889 395 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 B4GALT3O60512 393 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AP1G2O75843 785 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AMHP03971 560 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AMPD1P23109 780 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LSP1P33241 339 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MAGEA4P43358 317 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TKTL1P51854 596 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 XKR4Q5GH76 650 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BBS12Q6ZW61 710 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TNIP3Q96KP6 325 aa10.6□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MCF2LO15068 1137 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GPR182O15218 404 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KCNN4O15554 427 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TTC4O95801 387 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GOT1P17174 413 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BDNFP23560 247 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RBL1P28749 1068 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MDH1P40925 334 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SULT1E1P49888 294 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ACLYP53396 1101 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KDM7AQ6ZMT4 941 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 B3GALT6Q96L58 329 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SYT15Q9BQS2 421 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ULBP1Q9BZM6 244 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RSAD1Q9HA92 442 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10.59□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HCSTQ9UBK5 93 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms