RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DIP2AQ14689 1571 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MPP3Q13368 585 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TBCBQ99426 244 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SLIT1O75093 1534 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 POLLQ9UGP5 575 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GCNT1Q02742 428 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GPR141Q7Z602 305 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 KLK14Q9P0G3 267 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 AVPR1AP37288 418 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 BACE1P56817 501 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 AMHR2Q16671 573 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TADA1Q96BN2 335 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 HPCAP84074 193 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 IMPAD1Q9NX62 359 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 B3GAT3O94766 335 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 BGNP21810 368 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPASTQ9UBP0 616 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB16A2A368 324 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MEA1Q16626 185 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RMND5AQ9H871 391 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PXMP2Q9NR77 195 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF23P17027 643 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35C1Q96A29 364 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA5Q96PV4 448 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM245Q9H330 911 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GSNP06396 782 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK1P28482 360 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SOAT1P35610 550 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MMP14P50281 582 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 BLVRAP53004 296 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 FAM131BQ86XD5 332 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 F5H5T6 163 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CDH18Q13634 790 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A5Q92911 643 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RAD54BQ9Y620 910 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CYB561D2O14569 222 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM70O94826 608 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PRIM2P49643 509 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TMED10P49755 219 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-9P63128 1117 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 EMC1Q8N766 993 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 STK25O00506 426 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC6P62333 389 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RIN3Q8TB24 985 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 KRT87PA6NCN2 255 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GPR182O15218 404 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 STRNO43815 780 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GLRBP48167 497 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PGM2Q96G03 612 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MROH8Q9H579 483 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 UBE3AQ05086 875 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF844Q08AG5 666 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GANQ9H2C0 597 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms