RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 EFHC2Q5JST6 749 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 KCNT2Q6UVM3 1135 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CKAP2Q8WWK9 683 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SPC25Q9HBM1 224 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 ACSS2Q9NR19 701 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 TPH1P17752 444 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 MPP2Q14168 576 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 NOTUMQ6P988 496 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 MYLK2Q9H1R3 596 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 MROH8Q9H579 483 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 DDIT4Q9NX09 232 aa13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 GRIN3BO60391 1043 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 HOXC6P09630 235 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SERPINB6P35237 376 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SGF29Q96ES7 293 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 FSBPO95073 299 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 PMF1Q6P1K2 205 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 LGMNQ99538 433 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 HMBSP08397 361 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 MYL2P10916 166 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 TPI1P60174 286 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 POU5F1BQ06416 359 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB106AQ8N104 65 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 AAASQ9NRG9 546 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SENP1Q9P0U3 644 aa13.03□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 H3BRJ5 948 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 EPHB2P29323 1055 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 STIP1P31948 543 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 HADHBP55084 474 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 HUNKP57058 714 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 GBE1Q04446 702 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 VSTM1Q6UX27 236 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 RASSF3Q86WH2 238 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
UBXN4-201ENST00000272638 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 FZD9O00144 591 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 B3GAT3O94766 335 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 MTA2O94776 668 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 APOC2P02655 101 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 TAF12Q16514 161 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 PCSK7Q16549 785 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 XYLT1Q86Y38 959 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 CPT1BQ92523 772 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 FAM136AQ96C01 138 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 TNIP3Q96KP6 325 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 KDM4CQ9H3R0 1056 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 TLK1Q9UKI8 766 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 LAMB1P07942 1786 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 CYB561D2O14569 222 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 CXCL11O14625 94 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 HSPA4LO95757 839 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 MCF2P10911 925 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 FOXN2P32314 431 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 MLH1P40692 756 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 ITIH4Q14624 930 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 FITM2Q8N6M3 262 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 ZFP42Q96MM3 310 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 SDCBP2Q9H190 292 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.01□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.01□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
UBXN4-201ENST00000272638 ASPAP45381 313 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms