RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 WFS1O76024 890 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 BGNP21810 368 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MAP2K5Q13163 448 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF699Q32M78 642 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MFSD5Q6N075 450 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 DCLK2Q8N568 766 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM13CQ8NE31 585 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 CCDC138Q96M89 665 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ENPEPQ07075 957 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 AP1B1Q10567 949 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 EXD1Q8NHP7 514 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TTC8Q8TAM2 541 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 SPATA18Q8TC71 538 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 NRBF2Q96F24 287 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ARMCX1Q9P291 453 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 KCNN4O15554 427 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TGFB1I1O43294 461 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 HLA-DRAP01903 254 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 GSTT1P30711 240 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 AQP5P55064 265 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP24A1Q07973 514 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MCUQ8NE86 351 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 EME1Q96AY2 570 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 THAP11Q96EK4 314 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TISP43B9A030 160 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 AIM2O14862 343 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 KRT36O76013 467 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 CHKAP35790 457 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 HDAC11Q96DB2 347 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 NR2E1Q9Y466 385 aa11.97□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 FOCADQ5VW36 1801 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ABLIM1O14639 778 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 PDK4Q16654 411 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC19Q9H756 370 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 COL1A2P08123 1366 aa11.96□□□□□ -0.49
CLSTN3-201ENST00000266546 DPPA5A6NC42 116 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 CLPTM1O96005 669 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 MROH9Q5TGP6 573 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR20Q99678 358 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 F5H423 210 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 LGALS2P05162 132 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 INSRRP14616 1297 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 SSTR1P30872 391 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 SERPINB9P50453 376 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 SEZ6Q53EL9 994 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 CCT7Q99832 543 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.96□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 EDIL3O43854 480 aa11.95□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 PYGBP11216 843 aa11.95□□□□□ -0.5
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP2C9P11712 490 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms