RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.06■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.06■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 FGFR1P11362 822 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 AP3M2P53677 418 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ZNF394Q53GI3 561 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 GNASQ5JWF2 1037 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TSC22D3Q99576 134 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CCDC22O60826 627 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 UPP2O95045 317 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 NPTXRO95502 500 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 KRT1P04264 644 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 WEE2P0C1S8 567 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 VHLP40337 213 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SURF1Q15526 300 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 MIPEPQ99797 713 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 Q9Y3F1 56 aa21.05■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CYBAP13498 195 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SESN3P58005 492 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 EFHC2Q5JST6 749 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SIX4Q9UIU6 781 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 WDR91A4D1P6 747 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SMIM24O75264 130 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 HAUS5O94927 633 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TNNC2P02585 160 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ADRA1DP25100 572 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 NOMO3P69849 1222 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ZNF333Q96JL9 665 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 RNF19AQ9NV58 838 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 HES2Q9Y543 173 aa21.04■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 C7orf31Q8N865 590 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ANK1P16157 1881 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 PHBP35232 272 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TUBP50607 506 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 NOGQ13253 232 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 IRGCQ6NXR0 463 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 SYT15Q9BQS2 421 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 VCXQ9H320 206 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 POLIQ9UNA4 740 aa21.03■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TOMM70O94826 608 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ELNP15502 786 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 OVGP1Q12889 678 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ZNF699Q32M78 642 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CAPNS2Q96L46 248 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 PARVAQ9NVD7 372 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 RNF186Q9NXI6 227 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 IL18RAPO95256 599 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ALDH1A1P00352 501 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 ITGB3P05106 788 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 GNA15P30679 374 aa21.02■□□□□ 0.96
VGF-201ENST00000249330 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms