RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.56■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SPTLC1O15269 473 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ZBED1O96006 694 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 IL4RP24394 825 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SLC20A2Q08357 652 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 HHATQ5VTY9 493 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CCDC63Q8NA47 563 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.086e-8■■■□□ 18.4
USP10-201ENST00000219473 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KLC4Q9NSK0 619 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 APOL1O14791 398 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 APRTP07741 180 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 MYL3P08590 195 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 MSH2P43246 934 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 HDAC4P56524 1084 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CGB2Q6NT52 195 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.082e-10■□□□□ 10.8
USP10-201ENST00000219473 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.55■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KBTBD13C9JR72 458 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 RABGGTBP53611 331 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CCL14Q16627 93 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TLK2Q86UE8 772 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PQLC3Q8N755 202 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SGSM3Q96HU1 749 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ASMTLO95671 621 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SPARCL1Q14515 664 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 BOLA3Q53S33 107 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CYP2B6P20813 491 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 GBE1Q04446 702 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PKDCCQ504Y2 493 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 EFHC2Q5JST6 749 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FUKQ8N0W3 1084 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SNX25Q9H3E2 840 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.54■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KPNA7A9QM74 516 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 NR1H3Q13133 447 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 MFSD10Q14728 455 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 STILQ15468 1287 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TMEM110Q86TL2 294 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FAM131BQ86XD5 332 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TDRPQ86YL5 185 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 NRCAMQ92823 1304 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 A6NJR5 290 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CLDN5O00501 218 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ENDOD1O94919 500 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CYP2F1P24903 491 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ADRA1DP25100 572 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SNX17Q15036 470 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ZBTB6Q15916 424 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms