RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 MCM4P33991 863 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 NEUROD2Q15784 382 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 GLI2P10070 1586 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 SHPRHQ149N8 1683 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 ERVK-7P63135 1459 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 CLTCL1P53675 1640 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 ZMYM3Q14202 1370 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-222ENST00000639501 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 NGEFQ8N5V2 710 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 TRPM2O94759 1503 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 CLCN1P35523 988 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 TSPOAP1O95153 1857 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 TRAK2O60296 914 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 NEO1Q92859 1461 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-222ENST00000639501 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 C22orf23Q9BZE7 217 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 ATP7AQ04656 1500 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 AAMPQ13685 434 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 ERBB4Q15303 1308 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 RUNDC1Q96C34 613 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 PTPRTO14522 1441 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-222ENST00000639501 ABCA6Q8N139 1617 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 MRE11P49959 708 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 RAPGEF3O95398 923 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 WDR63Q8IWG1 891 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 MORC1Q86VD1 984 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-222ENST00000639501 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 STAC3Q96MF2 364 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 DDIT3P35638 169 aa25.87■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.87■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 HSCBQ8IWL3 235 aa25.87■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 RICTORQ6R327 1708 aa25.86■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 ESPNB1AK53 854 aa25.86■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.86■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.86■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.86■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.85■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.84■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 KANK1Q14678 1352 aa25.84■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.84■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 TET3O43151 1660 aa25.83■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 MTHFSP49914 203 aa25.83■■□□□ 1.73
PMS1-222ENST00000639501 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.82■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.82■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.82■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 CCDC27Q2M243 656 aa25.82■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 TRIM27P14373 513 aa25.81■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 DEPDC5O75140 1603 aa25.81■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 MYOM2P54296 1465 aa25.8■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.79■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 ZMYND15Q9H091 742 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PMS1-222ENST00000639501 KIF3BO15066 747 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 MROH2AA6NES4 1674 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 SMC5Q8IY18 1101 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 ADGRB2O60241 1585 aa25.76■■□□□ 1.71
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