RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636540.1

SRP54-AS1-205, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

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Gene SRP54-AS1, Length 565 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-205ENST00000636540 STAC3Q96MF2 364 aa16.19■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.18■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.18■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SHPRHQ149N8 1683 aa16.18■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.16■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.16■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.15■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 STK26Q9P289 416 aa16.15■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.15■□□□□ 0.18
SRP54-AS1-205ENST00000636540 BRINP3Q76B58 766 aa16.14■□□□□ 0.17
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.12■□□□□ 0.17
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 USP32Q8NFA0 1604 aa16.12■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SIRT1Q96EB6 747 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-205ENST00000636540 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-205ENST00000636540 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.08■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PRAM1Q96QH2 718 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 JCADQ9P266 1359 aa16.08■□□□□ 0.16
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 ITSN1Q15811 1721 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LRP6O75581 1613 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PXDNQ92626 1479 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NEUROD1Q13562 356 aa16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 POGKQ9P215 609 aa16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.02■□□□□ 0.15
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ATP7BP35670 1465 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 ABCA3Q99758 1704 aa15.99■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.99■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NUTM2FA1L443 756 aa15.98■□□□□ 0.15
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.93■□□□□ 0.14
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.93■□□□□ 0.14
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.92■□□□□ 0.14
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.88■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.87■□□□□ 0.13
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 CDK19Q9BWU1 502 aa15.86■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.85■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.84■□□□□ 0.13
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.83■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.82■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KCNA4P22459 653 aa15.81■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PSME1Q06323 249 aa15.81■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 POTEAQ6S8J7 498 aa15.81■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.81■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 AFF2P51816 1311 aa15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 EVC2Q86UK5 1308 aa15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NRAPQ86VF7 1730 aa15.8■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CABP2Q9NPB3 220 aa15.79■□□□□ 0.12
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