RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.38■■■□□ 2.29
CSAG3-202ENST00000617158 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.37■■■□□ 2.29
CSAG3-202ENST00000617158 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CSAG3-202ENST00000617158 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CSAG3-202ENST00000617158 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CSAG3-202ENST00000617158 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.33■■■□□ 2.29
CSAG3-202ENST00000617158 ADGRB2O60241 1585 aa29.32■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.31■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.29■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.29■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.29■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC7Q96M83 1385 aa29.28■■■□□ 2.28
CSAG3-202ENST00000617158 TMF1P82094 1093 aa29.26■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM94Q12767 1356 aa29.26■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.24■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 EVC2Q86UK5 1308 aa29.21■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 CDK19Q9BWU1 502 aa29.21■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.2■■■□□ 2.27
CSAG3-202ENST00000617158 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.2■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 MYOM1P52179 1685 aa29.19■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 SLC24A1O60721 1099 aa29.19■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 CABP2Q9NPB3 220 aa29.19■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 USP32Q8NFA0 1604 aa29.19■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.18■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.17■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CSAG3-202ENST00000617158 ATP7BP35670 1465 aa29.13■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 CDCA8Q53HL2 280 aa29.11■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.11■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.11■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.11■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 C14orf37Q86TY3 774 aa29.08■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CSAG3-202ENST00000617158 DCCP43146 1447 aa29.07■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.06■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 NUTM2FA1L443 756 aa29.06■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.05■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.04■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 MSH6P52701 1360 aa29.03■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 MST1RQ04912 1400 aa29.03■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.02■■■□□ 2.24
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 ITSN1Q15811 1721 aa29■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.99■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 CABP1Q9NZU7 370 aa28.99■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.96■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 ATF3P18847 181 aa28.96■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 TMC1Q8TDI8 760 aa28.96■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.96■■■□□ 2.23
CSAG3-202ENST00000617158 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.95■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 PANK3Q9H999 370 aa28.95■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 AKAP12Q02952 1782 aa28.94■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.94■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 ORAI2Q96SN7 254 aa28.92■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1W2PP64 1363 aa28.91■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.91■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.89■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.89■■■□□ 2.22
CSAG3-202ENST00000617158 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 ACEP12821 1306 aa28.88■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 SLAIN2Q9P270 581 aa28.87■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.87■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.86■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.86■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 KIF1AQ12756 1690 aa28.84■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 CERKQ8TCT0 537 aa28.84■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.84■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.83■■■□□ 2.21
CSAG3-202ENST00000617158 SSH2Q76I76 1423 aa28.82■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.82■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 BRINP3Q76B58 766 aa28.81■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 USP6P35125 1406 aa28.8■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CSAG3-202ENST00000617158 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 FOXO3O43524 673 aa28.75■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.74■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.72■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.71■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.71■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 PXDNQ92626 1479 aa28.71■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.71■■■□□ 2.19
CSAG3-202ENST00000617158 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.69■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 FYB1O15117 783 aa28.68■■■□□ 2.18
CSAG3-202ENST00000617158 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms