RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615024.4

RDM1-217, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 617 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-217ENST00000615024 CPS1P31327 1500 aa6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 WDR70Q9NW82 654 aa6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PTPRKQ15262 1439 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 KIF3BO15066 747 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 SOX12O15370 315 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PIP4K2BP78356 416 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 TNRQ92752 1358 aa6.26□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 MFRPQ9BY79 579 aa6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.25□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PLXNC1O60486 1568 aa6.24□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 NLRP1Q9C000 1473 aa6.24□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 SEMA3EO15041 775 aa6.24□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 BARGINQ6ZT62 677 aa6.24□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.24□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 SNPHO15079 494 aa6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 NLRP6P59044 892 aa6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 EID1Q9Y6B2 187 aa6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 CEP162Q5TB80 1403 aa6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.23□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PZPP20742 1482 aa6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 ILDR2Q71H61 639 aa6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 MICALL2Q8IY33 904 aa6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 TIAM1Q13009 1591 aa6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.22□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 KANK1Q14678 1352 aa6.21□□□□□ -1.41
RDM1-217ENST00000615024 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.21□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 SYNMO15061 1565 aa6.21□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 IQGAP1P46940 1657 aa6.2□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 MIA2Q96PC5 1412 aa6.2□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.2□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 DEPDC5O75140 1603 aa6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 PPP1R37O75864 691 aa6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 HSPA1LP34931 641 aa6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 E2F4Q16254 413 aa6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 MARVELD3Q96A59 401 aa6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 NCOA2Q15596 1464 aa6.19□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.18□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 POTEB3A0JP26 581 aa6.17□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 G3V3G9 751 aa6.17□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 POTEBQ6S5H4 581 aa6.17□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 MBD5Q9P267 1494 aa6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 AK7Q96M32 723 aa6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.16□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 MED14O60244 1454 aa6.15□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.15□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.15□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.15□□□□□ -1.42
RDM1-217ENST00000615024 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.15□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 ERVK-7P63135 1459 aa6.15□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 ABCC3O15438 1527 aa6.15□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 CEP152O94986 1710 aa6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 IL27Q8NEV9 243 aa6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 NECTIN2Q92692 538 aa6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 ERBINQ96RT1 1412 aa6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.14□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 ARID3AQ99856 593 aa6.13□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 MSH6P52701 1360 aa6.13□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.13□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 KIF15Q9NS87 1388 aa6.13□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 KIF3CO14782 793 aa6.12□□□□□ -1.43
RDM1-217ENST00000615024 EMP3P54852 163 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms