RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 IL21Q9HBE4 155 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 LILRB3O75022 631 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 HRCP23327 699 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 BRICD5Q6PL45 260 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZPR1O75312 459 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q3C1V9 767 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 C6orf229H3BNL8 230 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 MTMR2Q13614 643 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 TLL1O43897 1013 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPSB2Q99619 263 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNC4Q03721 635 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 RETREG3Q86VR2 466 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 CFAP99D6REC4 459 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 RFC5P40937 340 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRR7Q8TB68 274 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADH1BP00325 375 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 MSS51Q4VC12 460 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 AP1G2O75843 785 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 MMP16P51512 607 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 IFFO2Q5TF58 517 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 S1PR4O95977 384 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 JUNDP17535 347 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 DESI1Q6ICB0 168 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSC1Q92574 1164 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 LYPD8Q6UX82 237 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 BANK1Q8NDB2 785 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 SNRKQ9NRH2 765 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF223E7ERA6 249 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L8P0C7I0 530 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTPRNQ16849 979 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 GGCXP38435 758 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNH2Q12809 1159 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 FLIIQ13045 1269 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 MCM6Q14566 821 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A0G2JS52 829 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 NR6A1Q15406 480 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP10Q9P2G4 905 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 CTHP32929 405 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-87P-201ENST00000607561 SOCS7O14512 581 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPR37L1O60883 481 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 POM121Q96HA1 1249 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 COG6Q9Y2V7 657 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC19A1P41440 591 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPIAP49247 311 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 BAP1Q92560 729 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms