RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601357.6

SSBP4-209, Transcript of single stranded DNA binding protein 4, human

TSL 5

Gene SSBP4, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSBP4-209	ENST00000601357	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SSBP4-209	ENST00000601357	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SSBP4-209	ENST00000601357	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SSBP4-209	ENST00000601357	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
SSBP4-209	ENST00000601357	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SSBP4-209	ENST00000601357	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SSBP4-209	ENST00000601357	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SSBP4-209	ENST00000601357	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SSBP4-209	ENST00000601357	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
SSBP4-209	ENST00000601357	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SSBP4-209	ENST00000601357	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SSBP4-209	ENST00000601357	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SSBP4-209	ENST00000601357	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
SSBP4-209	ENST00000601357	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SSBP4-209	ENST00000601357	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	PXDN	Q92626	1479 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SSBP4-209	ENST00000601357	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SSBP4-209	ENST00000601357	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SSBP4-209	ENST00000601357	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SSBP4-209	ENST00000601357	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SSBP4-209	ENST00000601357	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SSBP4-209	ENST00000601357	FOXO3	O43524	673 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SSBP4-209	ENST00000601357	AFF2	P51816	1311 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SSBP4-209	ENST00000601357	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.05	■■■□□ 2.88	1e-6	■■■■□ 20.5
SSBP4-209	ENST00000601357	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SSBP4-209	ENST00000601357	POGK	Q9P215	609 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SSBP4-209	ENST00000601357	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SSBP4-209	ENST00000601357	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
SSBP4-209	ENST00000601357	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SSBP4-209	ENST00000601357	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SSBP4-209	ENST00000601357	RXRB	P28702	533 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SSBP4-209	ENST00000601357	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	PSME1	Q06323	249 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	USP21	Q9UK80	565 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.85
SSBP4-209	ENST00000601357	RGS12	O14924	1447 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	ATRN	O75882	1429 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	ATP7B	P35670	1465 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SSBP4-209	ENST00000601357	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	SLIT2	O94813	1529 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SSBP4-209	ENST00000601357	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SSBP4-209	ENST00000601357	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	GLI3	P10071	1580 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SSBP4-209	ENST00000601357	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.58	■■■□□ 2.81

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