RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599938.5

ZNF558-206, Transcript of zinc finger protein 558, human

TSL 5

Gene ZNF558, Length 780 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF558-206	ENST00000599938	JCAD	Q9P266	1359 aa		40.86	■■■■■ 4.13
ZNF558-206	ENST00000599938	DLC1	Q96QB1	1528 aa		40.86	■■■■■ 4.13
ZNF558-206	ENST00000599938	SIRT1	Q96EB6	747 aa		40.84	■■■■■ 4.13
ZNF558-206	ENST00000599938	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
ZNF558-206	ENST00000599938	PRAM1	Q96QH2	718 aa		40.78	■■■■■ 4.12
ZNF558-206	ENST00000599938	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		40.76	■■■■■ 4.12
ZNF558-206	ENST00000599938	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.76	■■■■■ 4.12
ZNF558-206	ENST00000599938	ORAI2	Q96SN7	254 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	40.74	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.73	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	POGK	Q9P215	609 aa		40.73	■■■■■ 4.11
ZNF558-206	ENST00000599938	NUTM2F	A1L443	756 aa		40.69	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	NEUROD1	Q13562	356 aa		40.69	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	ADGRB2	O60241	1585 aa		40.67	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		40.67	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		40.66	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.66	■■■■■ 4.1
ZNF558-206	ENST00000599938	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
ZNF558-206	ENST00000599938	LRP6	O75581	1613 aa		40.61	■■■■■ 4.09
ZNF558-206	ENST00000599938	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.59	■■■■■ 4.09
ZNF558-206	ENST00000599938	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
ZNF558-206	ENST00000599938	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.58	■■■■■ 4.09
ZNF558-206	ENST00000599938	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.56	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		40.54	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	PXDN	Q92626	1479 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		40.51	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	FOXO3	O43524	673 aa		40.51	■■■■■ 4.08
ZNF558-206	ENST00000599938	USP32	Q8NFA0	1604 aa		40.5	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.49	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		40.46	■■■■■ 4.07
ZNF558-206	ENST00000599938	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		40.44	■■■■■ 4.06
ZNF558-206	ENST00000599938	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
ZNF558-206	ENST00000599938	TONSL	Q96HA7	1378 aa		40.42	■■■■■ 4.06
ZNF558-206	ENST00000599938	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
ZNF558-206	ENST00000599938	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		40.36	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		40.33	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	SOCS7	O14512	581 aa		40.32	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		40.32	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	ITSN1	Q15811	1721 aa		40.32	■■■■■ 4.05
ZNF558-206	ENST00000599938	ATP7B	P35670	1465 aa		40.32	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	POTEA	Q6S8J7	498 aa		40.31	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.31	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		40.3	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.29	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.27	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		40.26	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.26	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	PSME1	Q06323	249 aa		40.26	■■■■■ 4.04
ZNF558-206	ENST00000599938	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.25	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	CDK19	Q9BWU1	502 aa		40.25	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	SBNO1	A3KN83	1393 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	AFF2	P51816	1311 aa		40.22	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		40.22	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		40.21	■■■■■ 4.03
ZNF558-206	ENST00000599938	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
ZNF558-206	ENST00000599938	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	40.17	■■■■■ 4.02
ZNF558-206	ENST00000599938	ARHGEF10	O15013	1369 aa		40.15	■■■■■ 4.02
ZNF558-206	ENST00000599938	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
ZNF558-206	ENST00000599938	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		40.13	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.13	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.11	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		40.11	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	ALS2	Q96Q42	1657 aa		40.09	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	ABCA3	Q99758	1704 aa		40.08	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	CABP2	Q9NPB3	220 aa		40.08	■■■■■ 4.01
ZNF558-206	ENST00000599938	PLEKHG5	O94827	1062 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	EVC2	Q86UK5	1308 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		40.04	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	ACE	P12821	1306 aa		40.01	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		40.01	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		40.01	■■■■■ 4
ZNF558-206	ENST00000599938	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
ZNF558-206	ENST00000599938	USP21	Q9UK80	565 aa		40	■■■■□ 3.99
ZNF558-206	ENST00000599938	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	39.99	■■■■□ 3.99
ZNF558-206	ENST00000599938	RXRB	P28702	533 aa		39.98	■■■■□ 3.99
ZNF558-206	ENST00000599938	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms