RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592940.2

GPX4-208, Transcript of glutathione peroxidase 4, human

TSL 5

Gene GPX4, Length 1,184 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPX4-208	ENST00000592940	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPX4-208	ENST00000592940	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPX4-208	ENST00000592940	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPX4-208	ENST00000592940	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPX4-208	ENST00000592940	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPX4-208	ENST00000592940	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GPX4-208	ENST00000592940	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77
GPX4-208	ENST00000592940	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPX4-208	ENST00000592940	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPX4-208	ENST00000592940	POGK	Q9P215	609 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GPX4-208	ENST00000592940	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.31	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GPX4-208	ENST00000592940	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPX4-208	ENST00000592940	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	PXDN	Q92626	1479 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GPX4-208	ENST00000592940	LRP6	O75581	1613 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	ATP7B	P35670	1465 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	FOXO3	O43524	673 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
GPX4-208	ENST00000592940	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPX4-208	ENST00000592940	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GPX4-208	ENST00000592940	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPX4-208	ENST00000592940	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPX4-208	ENST00000592940	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPX4-208	ENST00000592940	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
GPX4-208	ENST00000592940	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
GPX4-208	ENST00000592940	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GPX4-208	ENST00000592940	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	PSME1	Q06323	249 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.86	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
GPX4-208	ENST00000592940	ACE	P12821	1306 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPX4-208	ENST00000592940	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPX4-208	ENST00000592940	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPX4-208	ENST00000592940	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPX4-208	ENST00000592940	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPX4-208	ENST00000592940	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPX4-208	ENST00000592940	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	USP47	Q96K76	1375 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	AFF2	P51816	1311 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	TESK2	Q96S53	571 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPX4-208	ENST00000592940	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.71	■■■□□ 2.67

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