RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.31■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 PRAM1Q96QH2 718 aa29.3■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 NEUROD1Q13562 356 aa29.27■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 ORAI2Q96SN7 254 aa29.27■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.27■■■□□ 2.28
UBXN6-206ENST00000590466 JCADQ9P266 1359 aa29.25■■■□□ 2.27
UBXN6-206ENST00000590466 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
UBXN6-206ENST00000590466 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.23■■■□□ 2.27
UBXN6-206ENST00000590466 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
UBXN6-206ENST00000590466 POGKQ9P215 609 aa29.22■■■□□ 2.27
UBXN6-206ENST00000590466 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.22■■■□□ 2.27
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UBXN6-206ENST00000590466 NUTM2FA1L443 756 aa29.17■■■□□ 2.26
UBXN6-206ENST00000590466 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.17■■■□□ 2.26
UBXN6-206ENST00000590466 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.17■■■□□ 2.26
UBXN6-206ENST00000590466 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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UBXN6-206ENST00000590466 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
UBXN6-206ENST00000590466 SHPRHQ149N8 1683 aa29.11■■■□□ 2.25
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UBXN6-206ENST00000590466 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.08■■■□□ 2.25
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UBXN6-206ENST00000590466 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
UBXN6-206ENST00000590466 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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UBXN6-206ENST00000590466 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.04■■■□□ 2.24
UBXN6-206ENST00000590466 USP32Q8NFA0 1604 aa29.03■■■□□ 2.24
UBXN6-206ENST00000590466 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.03■■■□□ 2.24
UBXN6-206ENST00000590466 TONSLQ96HA7 1378 aa29.02■■■□□ 2.24
UBXN6-206ENST00000590466 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.02■■■□□ 2.24
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UBXN6-206ENST00000590466 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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UBXN6-206ENST00000590466 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
UBXN6-206ENST00000590466 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.95■■■□□ 2.22
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UBXN6-206ENST00000590466 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.79■■■□□ 2.2
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UBXN6-206ENST00000590466 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.79■■■□□ 2.2
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UBXN6-206ENST00000590466 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.75■■■□□ 2.19
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UBXN6-206ENST00000590466 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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UBXN6-206ENST00000590466 ALS2Q96Q42 1657 aa28.7■■■□□ 2.19
UBXN6-206ENST00000590466 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
UBXN6-206ENST00000590466 CABP1Q9NZU7 370 aa28.68■■■□□ 2.18
UBXN6-206ENST00000590466 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
UBXN6-206ENST00000590466 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
UBXN6-206ENST00000590466 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
UBXN6-206ENST00000590466 USP21Q9UK80 565 aa28.64■■■□□ 2.18
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