RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 DLC1Q96QB1 1528 aa28.92■■■□□ 2.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.91■■■□□ 2.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.87■■■□□ 2.21
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.86■■■□□ 2.21
EFTUD2-217ENST00000590124 JCADQ9P266 1359 aa28.84■■■□□ 2.21
EFTUD2-217ENST00000590124 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.83■■■□□ 2.21
EFTUD2-217ENST00000590124 PRAM1Q96QH2 718 aa28.82■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 ORAI2Q96SN7 254 aa28.81■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.8■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.8■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 SHPRHQ149N8 1683 aa28.8■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 ADGRB2O60241 1585 aa28.77■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 NEUROD1Q13562 356 aa28.77■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
EFTUD2-217ENST00000590124 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 POGKQ9P215 609 aa28.75■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 ILDR2Q71H61 639 aa28.73■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.72■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM2FA1L443 756 aa28.71■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.71■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.7■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 LRP6O75581 1613 aa28.68■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.68■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF1AQ12756 1690 aa28.67■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 USP32Q8NFA0 1604 aa28.67■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 PXDNQ92626 1479 aa28.66■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.65■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.65■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.64■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
EFTUD2-217ENST00000590124 FOXO3O43524 673 aa28.62■■■□□ 2.17
EFTUD2-217ENST00000590124 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.6■■■□□ 2.17
EFTUD2-217ENST00000590124 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.57■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.57■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 TONSLQ96HA7 1378 aa28.56■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.56■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.55■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.51■■■□□ 2.16
EFTUD2-217ENST00000590124 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP7BP35670 1465 aa28.51■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.51■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.5■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 ITSN1Q15811 1721 aa28.49■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.48■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.47■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 POTEAQ6S8J7 498 aa28.47■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 CDK19Q9BWU1 502 aa28.47■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.46■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.46■■■□□ 2.15
EFTUD2-217ENST00000590124 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 SBNO1A3KN83 1393 aa28.45■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.43■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 PSME1Q06323 249 aa28.43■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 SOCS7O14512 581 aa28.41■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.4■■■□□ 2.14
EFTUD2-217ENST00000590124 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 ADAMTS2O95450 1211 aa28.38■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 AFF2P51816 1311 aa28.38■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 C8orf37Q96NL8 207 aa28.37■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.37■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 ALS2Q96Q42 1657 aa28.37■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.36■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGEF10O15013 1369 aa28.35■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.34■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCA3Q99758 1704 aa28.33■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 CABP2Q9NPB3 220 aa28.33■■■□□ 2.13
EFTUD2-217ENST00000590124 NGLY1Q96IV0 654 aa28.31■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.31■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 EVC2Q86UK5 1308 aa28.3■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.29■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 ACEP12821 1306 aa28.29■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.28■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.27■■■□□ 2.12
EFTUD2-217ENST00000590124 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.26■■■□□ 2.11
EFTUD2-217ENST00000590124 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.26■■■□□ 2.11
EFTUD2-217ENST00000590124 USP21Q9UK80 565 aa28.22■■■□□ 2.11
EFTUD2-217ENST00000590124 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
EFTUD2-217ENST00000590124 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms