RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PKD2Q13563 968 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PCH4 1651 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX12O15370 315 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 MICALL2Q8IY33 904 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC3O15438 1527 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 HRCP23327 699 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 KANK1Q14678 1352 aa8.86□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 TET3O43151 1660 aa8.86□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 MADDQ8WXG6 1647 aa8.86□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.86□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 NEUROD1Q13562 356 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 ARSIQ5FYB1 569 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 SPOCK2Q92563 424 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS20O76081 388 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2R1Q13018 1463 aa8.83□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 NPATQ14207 1427 aa8.83□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.83□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.83□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.82□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.82□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 C3P01024 1663 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 CLTCL1P53675 1640 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNMO15061 1565 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYM3Q14202 1370 aa8.8□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 MROH2AA6NES4 1674 aa8.79□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK-7P63135 1459 aa8.78□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPM2O94759 1503 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRTO14522 1441 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 NOS1P29475 1434 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.76□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 RGL3Q3MIN7 710 aa8.76□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.76□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.76□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.76□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3C2BO00750 1634 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 TNRQ92752 1358 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 IDI1Q13907 227 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRMP28827 1452 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 TK2O00142 265 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF1BO60333 1816 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 TONSLQ96HA7 1378 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRB3O60242 1522 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC34A2O95436 690 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP33O14559 1287 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 IFT172Q9UG01 1749 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 IFFO2Q5TF58 517 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 STAC3Q96MF2 364 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP6P59044 892 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 PPLO60437 1756 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT7P0C024 238 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPA2P54652 639 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 LHX6Q9UPM6 363 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP1Q9C000 1473 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-208ENST00000589162 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms