RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-206	ENST00000588815	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CAPNS1-206	ENST00000588815	ADGRB2	O60241	1585 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CAPNS1-206	ENST00000588815	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	42.77	■■■■■ 4.44
CAPNS1-206	ENST00000588815	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CAPNS1-206	ENST00000588815	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CAPNS1-206	ENST00000588815	MIER1	Q8N108	512 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CAPNS1-206	ENST00000588815	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CAPNS1-206	ENST00000588815	ANP32C	O43423	234 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CAPNS1-206	ENST00000588815	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CAPNS1-206	ENST00000588815	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CAPNS1-206	ENST00000588815	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CAPNS1-206	ENST00000588815	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CAPNS1-206	ENST00000588815	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CAPNS1-206	ENST00000588815	HSPA2	P54652	639 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CAPNS1-206	ENST00000588815	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	PANK3	Q9H999	370 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	KCNA6	P17658	529 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	CDK19	Q9BWU1	502 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	CABP2	Q9NPB3	220 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CAPNS1-206	ENST00000588815	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CAPNS1-206	ENST00000588815	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CAPNS1-206	ENST00000588815	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	TMC1	Q8TDI8	760 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	ITSN1	Q15811	1721 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	USP32	Q8NFA0	1604 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	CCER2	I3L3R5	266 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CAPNS1-206	ENST00000588815	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	ATP7B	P35670	1465 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CAPNS1-206	ENST00000588815	RALBP1	Q15311	655 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	AKAP12	Q02952	1782 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CAPNS1-206	ENST00000588815	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815		A0A1W2PP64	1363 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	CABP1	Q9NZU7	370 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CAPNS1-206	ENST00000588815	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	NSD2	O96028	1365 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
CAPNS1-206	ENST00000588815	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	DCC	P43146	1447 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CAPNS1-206	ENST00000588815	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	NUTM2F	A1L443	756 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	NLRP13	Q86W25	1043 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CAPNS1-206	ENST00000588815	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CAPNS1-206	ENST00000588815	ACE	P12821	1306 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CAPNS1-206	ENST00000588815	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
CAPNS1-206	ENST00000588815	MRS2	Q9HD23	443 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CAPNS1-206	ENST00000588815	USP6	P35125	1406 aa		42	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	KIF1A	Q12756	1690 aa		42	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	MSH6	P52701	1360 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	MORC1	Q86VD1	984 aa		41.97	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	FYB1	O15117	783 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	ATF3	P18847	181 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
CAPNS1-206	ENST00000588815	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CAPNS1-206	ENST00000588815	PPP2R1A	P30153	589 aa		41.93	■■■■■ 4.3
CAPNS1-206	ENST00000588815	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CAPNS1-206	ENST00000588815	SSH2	Q76I76	1423 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CAPNS1-206	ENST00000588815	CCDC184	Q52MB2	194 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CAPNS1-206	ENST00000588815	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CAPNS1-206	ENST00000588815	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.91	■■■■■ 4.3

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