RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587472.5

CLASRP-208, Transcript of CLK4 associating serine/arginine rich protein, human

TSL 2

Gene CLASRP, Length 345 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLASRP-208	ENST00000587472	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CLASRP-208	ENST00000587472	ATRN	O75882	1429 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CLASRP-208	ENST00000587472	NAIP	Q13075	1403 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CLASRP-208	ENST00000587472	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CLASRP-208	ENST00000587472	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CLASRP-208	ENST00000587472	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		28.95	■■■□□ 2.22
CLASRP-208	ENST00000587472	MYOM2	P54296	1465 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CLASRP-208	ENST00000587472	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CLASRP-208	ENST00000587472	PXDN	Q92626	1479 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CLASRP-208	ENST00000587472	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
CLASRP-208	ENST00000587472	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CLASRP-208	ENST00000587472	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	EP400	Q96L91	3159 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	FOXO3	O43524	673 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CLASRP-208	ENST00000587472	NUTM2F	A1L443	756 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	STK26	Q9P289	416 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	KIF1A	Q12756	1690 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	TECPR2	O15040	1411 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CLASRP-208	ENST00000587472	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	GLI3	P10071	1580 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	USP32	Q8NFA0	1604 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	SLIT2	O94813	1529 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	ABCC11	Q96J66	1382 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
CLASRP-208	ENST00000587472	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CLASRP-208	ENST00000587472	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	PSME1	Q06323	249 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	VPS72	Q15906	364 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CLASRP-208	ENST00000587472	SIRT1	Q96EB6	747 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	LRP5	O75197	1615 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472		A0A0G2JS52	829 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	MYT1	Q01538	1121 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
CLASRP-208	ENST00000587472	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	28.5	■■■□□ 2.15
CLASRP-208	ENST00000587472	NRAP	Q86VF7	1730 aa		28.49	■■■□□ 2.15
CLASRP-208	ENST00000587472	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
CLASRP-208	ENST00000587472	PRAM1	Q96QH2	718 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CLASRP-208	ENST00000587472	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		28.47	■■■□□ 2.15
CLASRP-208	ENST00000587472	POGK	Q9P215	609 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CLASRP-208	ENST00000587472	BAG6	P46379	1132 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	ADGRB2	O60241	1585 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	DLC1	Q96QB1	1528 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	BTG4	Q9NY30	223 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
CLASRP-208	ENST00000587472	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CLASRP-208	ENST00000587472	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
CLASRP-208	ENST00000587472	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
CLASRP-208	ENST00000587472	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
CLASRP-208	ENST00000587472	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CLASRP-208	ENST00000587472	HRC	P23327	699 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CLASRP-208	ENST00000587472	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		28.31	■■■□□ 2.12

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