RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586531.5

USP36-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 3

Gene USP36, Length 898 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-205	ENST00000586531	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		40.69	■■■■■ 4.1
USP36-205	ENST00000586531	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.68	■■■■■ 4.1
USP36-205	ENST00000586531	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		40.68	■■■■■ 4.1
USP36-205	ENST00000586531	ORAI2	Q96SN7	254 aa		40.65	■■■■■ 4.1
USP36-205	ENST00000586531	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
USP36-205	ENST00000586531	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		40.59	■■■■■ 4.09
USP36-205	ENST00000586531	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		40.58	■■■■■ 4.09
USP36-205	ENST00000586531	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
USP36-205	ENST00000586531	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		40.58	■■■■■ 4.09
USP36-205	ENST00000586531	POTEA	Q6S8J7	498 aa		40.57	■■■■■ 4.09
USP36-205	ENST00000586531	ADGRB1	O14514	1584 aa		40.56	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.54	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	SIRT1	Q96EB6	747 aa		40.54	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.52	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
USP36-205	ENST00000586531	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.07
USP36-205	ENST00000586531	NUTM2F	A1L443	756 aa		40.5	■■■■■ 4.07
USP36-205	ENST00000586531	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		40.5	■■■■■ 4.07
USP36-205	ENST00000586531	DLC1	Q96QB1	1528 aa		40.5	■■■■■ 4.07
USP36-205	ENST00000586531	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
USP36-205	ENST00000586531	PRAM1	Q96QH2	718 aa		40.46	■■■■■ 4.07
USP36-205	ENST00000586531	STAC3	Q96MF2	364 aa		40.44	■■■■■ 4.06
USP36-205	ENST00000586531	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	40.43	■■■■■ 4.06
USP36-205	ENST00000586531	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.41	■■■■■ 4.06
USP36-205	ENST00000586531	PXDN	Q92626	1479 aa		40.41	■■■■■ 4.06
USP36-205	ENST00000586531	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.4	■■■■■ 4.06
USP36-205	ENST00000586531	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.38	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	FOXO3	O43524	673 aa		40.37	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	POGK	Q9P215	609 aa		40.37	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	ADGRB2	O60241	1585 aa		40.36	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		40.32	■■■■■ 4.05
USP36-205	ENST00000586531	USP32	Q8NFA0	1604 aa		40.31	■■■■■ 4.04
USP36-205	ENST00000586531	AFF2	P51816	1311 aa		40.28	■■■■■ 4.04
USP36-205	ENST00000586531	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.28	■■■■■ 4.04
USP36-205	ENST00000586531	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.25	■■■■■ 4.03
USP36-205	ENST00000586531	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
USP36-205	ENST00000586531	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
USP36-205	ENST00000586531	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
USP36-205	ENST00000586531	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		40.22	■■■■■ 4.03
USP36-205	ENST00000586531	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		40.2	■■■■■ 4.03
USP36-205	ENST00000586531	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.15	■■■■■ 4.02
USP36-205	ENST00000586531	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.15	■■■■■ 4.02
USP36-205	ENST00000586531	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		40.15	■■■■■ 4.02
USP36-205	ENST00000586531	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.14	■■■■■ 4.02
USP36-205	ENST00000586531	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		40.13	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	RXRB	P28702	533 aa		40.11	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		40.1	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.1	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		40.09	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		40.09	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		40.08	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		40.07	■■■■■ 4.01
USP36-205	ENST00000586531	ITSN1	Q15811	1721 aa		40.07	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	40.05	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	PSME1	Q06323	249 aa		40.05	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	40.05	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	ABCA3	Q99758	1704 aa		40.03	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	NEUROD1	Q13562	356 aa		40.03	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	SBNO1	A3KN83	1393 aa		40.02	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	USP21	Q9UK80	565 aa		40.01	■■■■■ 4
USP36-205	ENST00000586531	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	ATP7B	P35670	1465 aa		40	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	ALS2	Q96Q42	1657 aa		39.96	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		39.96	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		39.95	■■■■□ 3.99
USP36-205	ENST00000586531	RGS12	O14924	1447 aa		39.94	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		39.94	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	ARHGEF10	O15013	1369 aa		39.93	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		39.93	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	39.92	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	CDK19	Q9BWU1	502 aa		39.92	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	ATRN	O75882	1429 aa		39.91	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	PLEKHG5	O94827	1062 aa		39.91	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		39.91	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	39.91	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		39.91	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	39.9	■■■■□ 3.98
USP36-205	ENST00000586531	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	39.88	■■■■□ 3.97
USP36-205	ENST00000586531	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	39.87	■■■■□ 3.97
USP36-205	ENST00000586531	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	39.87	■■■■□ 3.97
USP36-205	ENST00000586531	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		39.86	■■■■□ 3.97
USP36-205	ENST00000586531	SLIT2	O94813	1529 aa		39.85	■■■■□ 3.97
USP36-205	ENST00000586531	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		39.82	■■■■□ 3.97
USP36-205	ENST00000586531	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		39.8	■■■■□ 3.96
USP36-205	ENST00000586531	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	39.78	■■■■□ 3.96
USP36-205	ENST00000586531	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	39.76	■■■■□ 3.96
USP36-205	ENST00000586531	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	39.76	■■■■□ 3.96
USP36-205	ENST00000586531	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		39.76	■■■■□ 3.96
USP36-205	ENST00000586531	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	39.75	■■■■□ 3.95

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