RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581381.5

FAM222B-208, Transcript of family with sequence similarity 222 member B, human

TSL 4 BASIC

Gene FAM222B, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM222B-208	ENST00000581381	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM222B-208	ENST00000581381	TECPR2	O15040	1411 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM222B-208	ENST00000581381	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM222B-208	ENST00000581381	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM222B-208	ENST00000581381	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FAM222B-208	ENST00000581381	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FAM222B-208	ENST00000581381	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.45	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.45	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	USP21	Q9UK80	565 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	MYOM2	P54296	1465 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	PXDN	Q92626	1479 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FAM222B-208	ENST00000581381	FOXO3	O43524	673 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	STK26	Q9P289	416 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	ATRN	O75882	1429 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.32	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.32	■■■□□ 2.77
FAM222B-208	ENST00000581381	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FAM222B-208	ENST00000581381	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FAM222B-208	ENST00000581381	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FAM222B-208	ENST00000581381	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
FAM222B-208	ENST00000581381	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FAM222B-208	ENST00000581381	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAM222B-208	ENST00000581381	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAM222B-208	ENST00000581381	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAM222B-208	ENST00000581381	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAM222B-208	ENST00000581381	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FAM222B-208	ENST00000581381	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	SLIT2	O94813	1529 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAM222B-208	ENST00000581381	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FAM222B-208	ENST00000581381	PSME1	Q06323	249 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FAM222B-208	ENST00000581381	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FAM222B-208	ENST00000581381	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FAM222B-208	ENST00000581381	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FAM222B-208	ENST00000581381	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	VPS72	Q15906	364 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.01	■■■□□ 2.72
FAM222B-208	ENST00000581381	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	POGK	Q9P215	609 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	GLI3	P10071	1580 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	EP400	Q96L91	3159 aa		32	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		31.95	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.95	■■■□□ 2.71
FAM222B-208	ENST00000581381	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.94	■■■□□ 2.7
FAM222B-208	ENST00000581381	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.93	■■■□□ 2.7
FAM222B-208	ENST00000581381	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FAM222B-208	ENST00000581381	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FAM222B-208	ENST00000581381	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FAM222B-208	ENST00000581381	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
FAM222B-208	ENST00000581381	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	HRC	P23327	699 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
FAM222B-208	ENST00000581381	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
FAM222B-208	ENST00000581381	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FAM222B-208	ENST00000581381	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
FAM222B-208	ENST00000581381	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.73	■■■□□ 2.67

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